2024年度採択課題一覧および研究成果報告書

共同研究員

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No	研究課題	共同研究員氏名	共同研究員所属	蛋白質研究所担当研究室
1	脂質化タンパク質LynのN末端ユニークドメインと内葉脂質の相互作⽤の解析	花島慎弥	⿃取⼤学	蛋⽩質有機化学研究室
2	ペプチドリガンドを⽤いた診断・治療薬剤の開発	⻑⾕川功紀	福島県⽴医科⼤学	蛋⽩質有機化学研究室
3	低温マイクロ波照射利⽤ペプチド合成装置のBoc法利⽤展開研究	清⽔弘樹	産業技術総合研究所	蛋⽩質有機化学研究室
4	エピジェネティクスを介した遺伝⼦発現に与える栄養の効果	末武勲	中村学園⼤学	蛋⽩質有機化学研究室
5	蛍光ナノダイヤモンドを⽤いた⽣細胞内における局所温度勾配阻害剤の検証	岡部弘基	東京⼤学	蛋⽩質ナノ科学研究室
6	⼀細胞粒度での分泌機能活性動態の解明	⽩崎善隆	東京⼤学	蛋⽩質ナノ科学研究室
7	⼈⼯結合タンパク質の標的分⼦群との相互作⽤解析	安井典久	岡⼭⼤学	分⼦創製学研究室
8	分⼦動⼒学シミュレーションによる、蛋⽩質とリガンドの分⼦間相互作⽤や結合⾃由エネルギーの算出に関する研究	神⾕成敏	兵庫県⽴⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
9	タンパク質複合体群の精密構造解析	⼤⼭拓次	⼭梨⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
10	チラコイド膜リモデリングタンパク質の電⼦顕微鏡トモグラフィーによる構造解析	坂本亘	岡⼭⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
11	緑⾊光を利⽤するハイブリッド光合成集光タンパク質の創成	藤井律⼦	⼤阪公⽴⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
12	新規な銅タンパク質の構造研究	藤枝伸宇	⼤阪公⽴⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
13	細胞内で集合体を形成する解糖系酵素エノラーゼ変異体の構造解析	三浦夏⼦	⼤阪公⽴⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
14	糖質加⽔分解酵素ファミリー85 に属する酵素の基質認識機構	宮原郁⼦	⼤阪公⽴⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
15	クロロフィルのマグネシウム脱離酵素の構造解析	伊藤寿	北海道⼤学	蛋⽩質結晶学研究室
16	蛋⽩質アルギニンメチル基転移酵素１の希薄溶液中での基質結合依存的な会合状態の評価	藤間祥⼦	奈良先端科学技術⼤学院⼤学	超分⼦構造解析学研究室
17	バクテリオファージの⽴体構造解析	武⽥茂樹	群⾺⼤学	超分⼦構造解析学研究室
18	細菌の細胞分裂タンパク質複合体の構造解析	松村浩由	⽴命館⼤学	超分⼦構造解析学研究室
19	オルガネラおよび⼩胞の細胞内輸送におけるプロトンポンプV-ATPase a サブユニットと輸送調節因⼦Rabタンパク質との相互作⽤	中⻄真⼸	岩⼿医科⼤学	超分⼦構造解析学研究室
20	微⽣物由来ジペプチジルアミノペプチターゼの構造機能相関	阪本泰光	岩⼿医科⼤学	超分⼦構造解析学研究室
21	Pycocuccus furiosus およびGeobacillus kaustophilusを⽤いたウイルス様粒⼦への磁性ナノ粒⼦の合成と磁気緩和の検出	⽩⼟優	⼤阪⼤学	超分⼦構造解析学研究室
22	光合成関連遺伝⼦の発現制御に関わるタンパク質の明暗条件下でのスイッチング機構解明	海野昌喜	茨城⼤学	超分⼦構造解析学研究室
23	分⼦モータータンパク質の活性化複合体の形成	丹⽻伸介	東北⼤学	超分⼦構造解析学研究室
24	電位センサータンパク質群の動作機構の解明に向けた計算科学アプローチ	近藤寛⼦	北⾒⼯業⼤学	超分⼦構造解析学研究室
25	CENP-TWSX複合体によるDNA認識機構解明	⻄野達哉	東京理科⼤学	超分⼦構造解析学研究室
26	分⼦シミュレーションによる電位依存性膜タンパク質VSPの輸送機構研究	⽶澤康滋
27	ウイルス形成場バイロプラズマにおけるウイルス粒⼦形成機構解明を⽬指した構造⽣物学的研究	東浦彰史
28	リソソームエキソサイトーシスを制御するCa2+チャネルTRPML1複合体の構造解析	上⻄達也
29	In-situ光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質の光反応過程に現れる光中間体の定常捕捉と構造解析	内藤晶
30	アミロイド線維および液-液相分離形成過程における構造変化の追跡	宗正智
31	DNP-NMR法によるスピンラベルタンパク質の構造解析	荒⽥敏昭
32	カゴ型ホスト錯体を⽤いた⾼分解能DNP固体NMR測定とカプセル型中空錯体の保護効果に基づく細胞内観測⽤耐還元型ラジカル偏極剤の調製	佐藤宗太
33	ヒト細胞内アミロイド凝集のDNPによる選択的⾼感度NMR解析	池中建介
34	アミロイド原性蛋⽩質を⽤いた蛋⽩質凝集機構の解明	後藤祐児
35	アルツハイマー型認知症を発症する遺伝⼦組換えマウスを⽤いた聴覚機能の測定と解析	⽇⽐野浩
36	減数分裂期DNA損傷応答と鋳型選択システムの解明	篠原美紀
37	低分⼦量Gタンパク質を介した細胞内シグナルによる細胞⾻格および細胞内輸送制御機構	宮本昌明
38	⽣物に普遍的に存在するtRNA wobble位ウリジン修飾に関する研究	中井由実
39	新規葉緑体光定位運動制御因⼦における相互作⽤因⼦の探索	⽐嘉毅
40	scRNA-seqデータを利⽤可能な遺伝⼦ネットワーク同定法の開発	⽊村周平
41	⼀細胞データによるシスエレメント活性情報同定⼿法の開発	粕川雄也
42	YAPメカノホメオスターシス動態のシステムバイオロジー解析	清⽊誠
43	⾃然⾔語処理の埋め込み法を⽤いたゲノムスケールでの蛋⽩質間相互作⽤予測法の⾼精度化	村上洋⼀
44	⾦属イオン結合に伴い変化する蛋⽩質の動的構造解析	織⽥昌幸
45	アロステリック制御によるタンパク質動的分⼦構造変化の機構解明	櫻井⼀正
46	フロー型NMRを⽤いた薬剤スクリーニングシステムの開発	児嶋⻑次郎
47	シグナル伝達タンパク質の動的構造解析	杤尾豪⼈
48	飢餓環境でがん幹細胞が⽣残優位性を発揮する分⼦機構の解明と鍵分⼦の同定	岸本幸治
49	⼈⼯設計タンパク質の多量体化によるヘム結合サイトの設計⼿法の開発	近藤未菜⼦
50	酵素活性や複合体形成能を持つDe Novo蛋⽩質の設計	⼩杉貴洋
51	分泌蛋⽩質EGF like domain multiple 6 (EGFL6)の動脈硬化、⾼⾎圧における機能検討	豊原敬⽂
52	細胞内超分⼦構造体の構成タンパク質の固体NMR解析	⽵内恒
53	クライオ電⼦顕微鏡解析で紐解くダイナミンおよびBARドメイン蛋⽩質の膜リモデリング機構とその破綻に起因する難治性疾患の発症機序	⽵⽥哲也
54	特異的化学修飾によるタンパク質の機能化に関する研究	国嶋崇隆
55	Machine Learning-Assisted Design for Cellular Toxicity Profiles of Amorphous Silica Nanoparticles	MARTIN
56	滑膜⾁腫関連タンパク質の構造解析	岩崎憲治
57	疎⽔性タンパク質の効率的合成を指向した新規ペプチドライゲーション法の開発	鳴海哲夫

国際共同研究

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No	研究課題	国際共同研究員氏名	国際共同研究員所属	所在国	蛋白質研究所担当研究室
1	Selective Protein Bioconjugation via Basicity-Modulated Lysine Derivatives.	Christoph Nitsche	Australian National University	Australia	蛋⽩質有機化学研究室
2	Establishment of the efficient synthetic route of macrocyle FAP-2286	Gloria Lourdes Serra Lemes	Universidad de la Republica	Uruguay	蛋⽩質有機化学研究室
3	Crystallization, X-ray diffraction, and structural analysis of halophilic cellulase (CelGH5) from Indonesia local isolate	Ni Nyoman Tri Puspaningsih	Universitas Airlangga, Indonesia	INDONESIA	蛋⽩質結晶学研究室
4	Crystal structure of aminoimidazole ribonucleotide synthetase	Chun-Jung Chen	National Synchorotron Radiation Research Center	Taiwan	超分⼦構造解析学研究室
5	Structure of Fra1 prolyl aminopeptidase from Saccharomyces cerevisiae	Hyun Kyu Song	Korea University	South Korea	超分⼦構造解析学研究室
6	Structural and functional s tudy on the survival essential factors from bacterial pathogens for the development of novel antibiotics which induce suicide effect (phase IV)	Bong-Jin Lee	Ajou University	Korea	超分⼦構造解析学研究室
7	Structural analysis of target proteins involved in the Butyrate cycle from Faecalibacterium prausnitzii A2-165	Kwang Yeon Hwang	Korea University	Korea	超分⼦構造解析学研究室
8	Elucidanting the Structures of Anticancer Target Proteins and Their Complexes with Inhibitors	Hyoun Sook Kim	National Cancer Center	Korea	超分⼦構造解析学研究室
9	Structural study of Cell penetrating peptides	Lee Soo Jae	Chungbuk National University	Korea	超分⼦構造解析学研究室
10	Structure and function of industrial enzymes extremophilic bacteria	Mohd Shukuri Mohamed Ali	Universiti Putra Malaysia	Malaysia	超分⼦構造解析学研究室
11	Single-Molecule Studies on the Regulation Mechanism of DNA Recombination Machinery	Hung-Wen Li	National Taiwan University	Taiwan	ゲノム-染⾊体機能研究室
12	Computational modelling of EML4-ALK signaling pathway	IOSIFINA SAMPSON	University of Leeds	UNITED KINGDOM	細胞システム研究室
13	A systems biology approach to overcoming treatment resistance in B-cell malignancies	Simon Mitchell	University of Sussex	United Kingdom	細胞システム研究室
14	Development of an in-silico design protocol of peptide inhibitors for protein protein interactions	Thana Sutthibutpong	King Mongkut's University of Technology Thonburi	Thailand	計算⽣物学研究室
15	A New approach to explore proteins binding interfaces flexibility using biased molecular dynamic and normal mode analysis.	Thibault Michel Joseph Tubiana	Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), CNRS/CEA	France	⽣体分⼦動態モデリング研究室
16	Computational investigation of dynamically coupled interfaces in bHLH -PAS domain transcription factors	ASHUTOSH SRIVASTAVA	INDIAN INSTITUTE OF TECHNOLOGY GANDHINAGAR	INDIA	⽣体分⼦動態モデリング研究室
17	Functional dynamics of a human ubiquitin C-terminal hydrolase studied by SAIL NMR	Hsu Shang-Te Danny	Institute of Biological Chemistry, Academia Sinica	Taiwan	⾼磁場NMR分光学研究室
18	Structural and Functional Roles of cis-Proline in Intrinsically Disordered Proteins	BASU GAUTAM	Indian Institute of Science Education and Research Kolkata	INDIA	計算⽣物学研究室

超高磁場ＮＭＲ共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	タンパク質凝集の動的構造解析	菅瀬謙治	京都⼤学
2	⾼圧⼒NMR法による⽣体⾼分⼦の構造とダイナミクスの研究	北原亮	⽴命館⼤学
3	疾患関連蛋⽩質、機能性核酸、草⽊バイオマス抽出物の構造・機能・分⼦運動相関解析	永⽥崇	京都⼤学
4	抗体の⾮標識NMR計測法の開発と応⽤	加藤晃⼀	⽣命創成探究センター
5	細胞内恒常性維持を担う動的シャペロン複合体の構造解析	齋尾智英	徳島⼤学
6	細胞内環境におけるタンパク質の構造変化の原⼦レベル解析	森本⼤智	京都⼤学
7	⾎清アミロイドAの線維形成における主要な構造変化	星野⼤	京都⼤学
8	リシン側鎖がアクセプターとなる⽔素結合のNMR解析	三島正規	東京薬科⼤学
9	PENDタンパク質のN末DNA結合領域が細胞内局在を制御する構造要因	森⽥勇⼈	城⻄⼤学
10	⼆機能クリプトクロムの構造ダイナミクスに関する溶液NMR解析	久保稔	兵庫県⽴⼤学
11	炎症および認知症関連の会合体形成タンパク質の⽴体構造と相互作⽤のNMR解析	寺沢宏明	熊本⼤学
12	藍⾊細菌⽣物時計発振機構の解析	武藤梨沙	東邦⼤学
13	薬剤により誘起される天然変性タンパク質の構造動態変化のNMR による観察	廣明秀⼀	名古屋⼤学

クライオ電子顕微鏡共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	創薬開発に資するヒト膜タンパク質の構造解析	寿野良⼆	関⻄医科⼤学
2	クライオ電⼦顕微鏡を⽤いた創薬標的膜タンパク質の構造解析	浅⽥秀基	京都⼤学
3	膜内切断プロテアーゼのクライオ電⼦顕微鏡解析	⽲晃和	横浜市⽴⼤学
4	クライオ電⼦顕微鏡による新規センサータンパク質の単粒⼦構造解析	村⽊則⽂	慶應義塾⼤学
5	ロドプシンのクライオ電顕単粒⼦解析	錦野達郎	名古屋⼯業⼤学
6	深層学習による多剤耐性菌の画像判別法の開発	⻄野邦彦	⼤阪⼤学
7	ビブリオ菌べん⽑モーター固定⼦複合体の⽴体構造解析	⼩嶋誠司	名古屋⼤学

MicroED共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	⽔の酸化を促進する錯体触媒の重要反応中間体の構造解析	⼋⽊政⾏	新潟⼤学
2	単結晶と超分⼦ポリマーの中間に位置する未知結晶形態の構造解析	林正太郎	⾼知⼯科⼤学
3	メカノケミカル法によって形成される特異な多成分結晶の合成とMicroED結晶構造解析に基づく多成分化に伴う物理化学的特性変化の機構解明	佐々⽊俊之	⾼輝度光科学研究センター
4	機能性シアノ⾦属錯体の結晶構造解析	⼤⾕亮	九州⼤学
5	陸上テトロドトキシンの⽣合成中間体および放線菌由来⼆次代謝産物の構造決定	⼯藤雄⼤	東北⼤学
6	MicroEDによるラダー型有機分⼦の結晶構造解析	⽯割⽂崇	⼤阪⼤学
7	含硫⻩半導体MOFの結晶構造解析	⽥中⼤輔	関⻄学院⼤学
8	⾮共平⾯的に芳⾹環が集積したナフタレンジケトン類縁体群の結晶構造解析：⾮古典的⽔素結合相互作⽤と分⼦集積構造の相関解明	岡本昭⼦	東京農⼯⼤学
9	3次元有機構造体の微⼩単結晶構造解析	瀬川泰知	分⼦科学研究所
10	π共役系炭化⽔素の極微⼩結晶の構造解析	⻄内智彦	⼤阪⼤学

客員フェロー

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	ほ乳類の⽣殖能⼒を制御する分泌蛋⽩質の⽣理機能解析	淨住⼤慈	基礎⽣物学研究所
2	多剤排出トランスポーターの結晶構造解析およびクライオ電顕構造解析	村上聡	東京科学⼤学

2024年度 採択課題一覧および成果報告書

採択課題一覧

成果報告書

共同研究員

国際共同研究

超高磁場ＮＭＲ共同利用研究課題

クライオ電子顕微鏡共同利用研究課題

MicroED共同利用研究課題

客員フェロー

2024年度採択課題一覧および成果報告書